Miejsca modlitwy
Miejsca modlitwy to miejsca niezwykle ważne dla każdego pielgrzyma. Tu spotykamy się z Bogiem, by w ciszy serca i spokoju z Nim rozmawiać. To czas, kiedy otwieramy się na głos Pana Boga.
Kaplica Adoracji
Za rzędem konfesjonałów znajduje się wąska ścieżka, która prowadzi do Kaplicy Adoracji. Kaplica Adoracji została wybudowana w 1991 roku. Chętnie zaglądają do niej wierni, szukający odpowiedniego miejsca do duchowej refleksji, gdyż w ciągu dnia można się tu w ciszy pomodlić przed Najświętszym Sakramentem. Z powodu braku miejsca w sanktuarium przed południem odprawiane są tam Msze św. w różnych językach, lecz po południu kaplica jest otwarta, by pielgrzymi prywatnie mogli modlić się w ciszy.
W kaplicy adoracji w 2000 roku umieszczono płaskorzeźby przedstawiające pięciu księży pochodzących z tej parafii, męczenników, których komuniści zamordowali za wiarę pod koniec II wojny światowej.
Figura Matki Bożej Królowej Pokoju
Na początku placu przed kościołem, po prawej stronie znajduje się kamienna figura Matki Bożej Królowej Pokoju. Autorem tego dzieła, które znajduje się tu od 1987 r., jest włoski rzeźbiarz Dino Felicio z Avenzo Carrary. Stała się symbolem sanktuarium. Została wykonana na zamówienie szwajcarskiej rodziny Studer-Steffen, jako dar wotywny.
Wokół figury Matki Bożej nieustannie spotkać można dziesiątki pielgrzymów, którzy modlą się o pokój dla całego świata, odmawiając różaniec, chodząc dookoła figurki na kolanach.
Miejsce pojednania
Jedno z głównych przesłań objawień stanowi wezwanie do pojednania z Bogiem poprzez spowiedź świętą. Od początku objawień przybywający do Medjugorie chcieli właśnie tutaj wyznać swoje grzechy. W odpowiedzi na potrzeby wiernych, franciszkanie administrujący parafią w roku 1990 roku wybudowali po lewej stronie kościoła osobny budynek, w którym znalazło się 25 konfesjonałów, gdzie wierni codziennie mogą przeżyć spotkanie z Bożym przebaczeniem. W nich pielgrzymi z różnych krajów mogą wyspowiadać się w swoim języku.
Figura św. Leopolda Bodgana Mandića
W pobliżu konfesjonałów w roku 1998 postawiono figurę św. Leopolda Bodgana Mandića, patrona spowiedników, który 16 października 1983 r. został wyniesiony na ołtarze przez papieża Jana Pawła II. Dzieło zostało wykonane z brązu, a jego autorem jest Carmelo Puzzolo z Włoch. Na cokole wznosi się sylwetka starszego mężczyzny z długą brodą, o łagodnym wyrazie twarzy. Ma na sobie habit zakonny i stułę,a w dłoniach trzyma różaniec.
Drewniany krzyż
Po prawej stronie kościoła św. jakuba Apostoła, pod drewnianym krzyżem zlokalizowane jest miejsce przeznaczone na modlitwę w ciszy i skupieniu. Tutaj pielgrzymi mogą także zapalić świece wotywne. Przestrzeń wokół drewnianego krzyża powstała w roku 2000.
Na placu za bujnym żywopłotem i aleją drzew wybudowano wówczas kamienne wzniesienie w kształcie wąskich schodów, biegnących z prawej i lewej strony. W centrum umieszczono duży krzyż z figurą Chrystusa, a tuż pod nim bije małe źródełko symbolizujące swego rodzaju “fontannę łask”. U stóp krucyfiksu w półokręgu ustawiono świece.
Figura Zmartwychwstałego Chrystusa
Wśród posągów rozsianych na mapie sanktuarium w Medjugorie, skupiających wokół siebie rozmodlonych wiernych, z pewnością nie można pominąć figury Zmartwychwstałego Chrystusa. Po południowo-zachodniej stronie kościoła przy drodze w kierunku cmentarza na Wielkanoc 1998 roku postawiono wykonaną z brązu figurę Zmartwychwstałego Zbawiciela. Jest dziełem słoweńskiego rzeźbiarza Andreja Ajdiča. Mierząca blisko 8 m wysokości rzeźba Zbawiciela to obiekt wyróżniający się na tle innych. Jest to jedno z miejsc parafii przyciągających najwięcej osób. W ciągu każdego dnia, ale także po zachodzie słońca wokół figury Zmartwychwstałego modlą się dziesiątki pielgrzymów adorujących Zbawiciela. Wokół niej na Wielkanoc 2002 roku stworzono miejsce przeznaczone do odmawiania drogi krzyżowej dla tych, którzy nie mogą pójść na Križevac.
Dom spotkań
Cmentarz Kovačica
Na cmentarzu Kovačica spoczywa między innymi niezwykle zasłużony dla rozwoju Medjugorje franciszkanin ojciec Slavko Barbarić. Jego grób odwiedzają nie tylko podopieczni Matczynej Wioski i Wspólnoty Cenacolo, ale także liczni pielgrzymi zafascynowani niezwykłą sylwetką zakonnika. na cmentarzu spoczywa również ojciec Križan Galić, proboszcz – zabity przez komunistycznych partyzantów w pomieszczeniach dzisiejszej kancelarii parafialnej.